La création de l'Établissement public du Grand Palais en janvier 2007 marque un tournant dans l'histoire du monument : c'est la première fois, depuis son édification, qu'une structure unique assure l'ensemble de sa gestion.
En 2011, nouveau tournant : l'Etablissement public du Grand Palais fusionne avec la Réunion des musées nationaux aux termes du décret du 13 janvier 2011. Précédemment Président du Grand Palais et du Conseil d'administration de la Rmn, Jean-Paul Cluzel devient président du nouvel Etablissement public de la Rmn-Grand Palais par décret du 20 janvier 2011 pour un mandat de 5 ans.